祝由，是在《黄帝内经》成书之前，上古真人治病的方法，最早见于《黄帝内经》第13章。“黄帝问曰：余闻古之治病，惟其移精变气，可祝由而己。今世治病，毒药治其内，针石治其外，或愈或不愈，何也？”藉由黄帝之口道出时人与古人治病方法的区别，时人治病用药，而古人只要对病人移易精神和改变气的运行即可。足见“祝由”治病的玄妙。
祝由医学：符咒治病 移易精神
符咒是道教法术的重要组成部分，在其发展过程中逐步完善，逐渐形成了一套用于治病的符图咒语，“祝由之法”需借助符咒，二者息息相关，这种“祝由之法”在医学中称作祝由医学，也称祝由科。
祝由医学实施的一般步骤
祝由医学治病须遵守五条戒律：不诚不敬者不治，毁谤天医者不治，疑信不决者不治，重财轻命者不治，符咒不合不全者不治。
道教徒在施术前必须沐浴净身，设坛摆供，焚香祈祷，然后行祝水咒：“天以一生，地以六成，一六既合，活泼澄清，在天为雨露，利万物而不穷，在地为江湖，会一元而统宗，请为法水，道气归宗，噀洒坛室，邪秽灭踪，滋研翰墨，书符建功。”
再念祝墨咒：“松筠动质蕙兰凝香，磨书黄素，获纳祯祥。”
再念祝纸咒：“取玉之英，天地生成，龙章凤篆，资之以陈，书就神符万应万灵。”
再念祝笔咒：“兔毫象管烈日飞霜，请神笔下道气滋洋，书符疗病效如神响。”
最后念祝文：“炉焚室香直透穷苍，至灵至圣感应显扬。伏以上古大圣轩辕黄帝制作祝由科神术符章，疗世间男妇小儿诸般内外疾病，又能驱邪缚魅，其功甚妙，验于药饵。凡夫俗子视为异端邪说。切弟子某某偶遇度师张道陵传授秘书，钦承黄帝符章。广行方便济弱扶倾。今有某省某县某人居住某处身患某并，谨于某年某月某日特在此处诚焚香祷祝病由，日出东方照定西方叩请：上古圣帝诸位药王老祖圣师，后学素公权先师，后学素辉徐公先师部下，捧水磨墨使者持纸执笔童郎普同降临，弟子代为祝告在前恳乞。圣帝祖师天赐照灵神功速应，保全患人。如日不辜所祷。”
再念书符咒三遍：“天圆地方律令九章，捻笔在手万病除殃，吾奉太上老君急急如律令。”
根据病患者需要可画相应符图。
最后念送文：“适成弟子迎请冒渎神圣，敢焚宝香，今当奉请送。有所术，还当叩请启首归穷太上无极大道（随叩齿三次）。”
治病过程的常念咒语
在治病过程中最常念的咒语是“轩辕皇帝治病神咒”：天地既判，五雷初分，三元悠列，八卦成形。人有病患，皆由五行，按病序药，方在皇农。先天有道，内循五脏，外平七情，人有诚念，无感不通。山有五岳，斗有七星，随我所指，诸症技穷。轩辕帝道，蚩尤避兵，速消速愈，顷刻通灵。急急如太上元始慈悲赦。
在传统文化的古籍记载中，咒语的功能大致可分为：息灾灭祸、祈福保安、增益开慧、强身治病等作用。由于咒语凝集了自然界中的特殊信息，施术者本身的嗔气加上隐态能量的帮助，其作用和威力是巨大的，它可传播到很远的地方，可振动相应的目标、脏腑和其它物质。用咒语治病可使施术者节省大量真气，减少自身损耗获得事半功倍之效。咒语具有方向性、思维性、目标性等几大特点，它不但可治病，同时也可制人，甚至可给隐态物质传达信息，具有特异的调动自然界能量的功能和作用。
祝由医学对医师的要求
祝由治病基本不用药物，主用祝由师的意念、符咒产生的场来治疗各类疾病，在这个过程中祝由师需要遵守多条戒律。其一，需要清净斋戒百日，以使内心平静，心无杂念，意念专一，排除干扰，提高疗效。其二，状态要佳，咒出病愈，符进病出。其三，练气功提高自己的人体场，以借助咒语、符图，使得病邪排出体外，使得元气得以补充，经络得以疏通。练气功，寻合适之法，为人消除疑难病症，济世度人。
