一、自身免疫反应：多数学者认为本病属于自身免疫性疾病。因为本病并发自身免疫病（如自身免疫性溶血性贫血）者较多，肾上腺皮质激素能使病情缓解，在部分患者的血清中可查到抗结肠上皮细胞抗体，所以认为本病的发生可能与自身免疫反应有关。另外，某些患者感染肠道菌后，可与结肠上皮细胞抗原起免疫反应，损伤结肠粘膜，并且患者的淋巴细胞对胎儿结肠上皮细胞有细胞毒作用，提示怀疑结肠炎的发生还可能与细胞免疫异常有关。
二、感染：本病的病理变化和临床表现与一些结肠感染性疾病（如细菌性痢疾）相似，所以有些人认为感染是本病的病因。在细菌、真菌和病毒等多种因素中，现在的研究表明病毒的可能性较大。
三、遗传：本病的血缘家庭发病率较高，据欧美文献统计，溃疡性结肠炎病人的直系血缘亲属中，约15-30%的人发病。此外双胞胎的研究表明，单合子比双合子更容易发病，也就是说本病的发生可能与遗传因素有关系。
四、神经精神因素：有人认为精神因素在发病中起一定作用，患者多有某些性格特征，对于生活中重大事件的心理承受能力和适应性差，属心身疾病一类，心身疾病强调心里因素在疾病的发生或病程中起重要作用，有人将7种疾病列为心身疾病，即：哮喘，类风湿性关节炎，溃疡性结肠炎、原发性高血压，神经性皮炎、甲状腺功能亢进和十二指肠溃疡。目前可能有更多疾病被列为心身疾病。
1.起病缓慢，多呈慢性、迁延性，反复发作性，少数突发起病，呈持续进展或暴发性过程。
2.消化系统表现：腹痛和腹泻最为常见，腹痛位于左下腹，隐痛、绞痛，便后缓解。腹泻以粘液脓血便最常见，每日数次至10次不等，常伴里急后重。尚有恶心、呕吐、食欲不振。
3.全身症状：贫血，消瘦，低蛋白血症，水电解质紊乱，精神焦虑。
4.肠外表现：常有关节炎，结节性红斑，慢性活动性肝炎，口腔溃疡等。
5.左下腹压痛，部分患者可触及条索状增厚或痉挛的肠管。
6.如有并发症则有相应表现。
