(一)发病原因：
近年来有人报道溶组织内阿米巴原虫中，有些无致病力，可以在某些人肠道中长期存活而不引起症状，无致病力的虫株具有与有致病力虫株不同的表面抗原成分，而且亦不产生蛋白溶解酶，其宿主血中亦不产生相应的抗体。
(二)发病机制：
溶组织阿米巴原虫在其生活史中出现滋养体及包囊期两种不同形态，包囊被人食入后，可无损地通过胃及小肠上段，到小肠下段经胰蛋白酶消化，具有4个核的成熟包囊，可脱囊而出成为小滋养体(直径7～20?m)，寄生在肠腔中，以细菌为食物，不损伤肠壁组织，二均分裂繁殖，在缺氧的回盲部生长良好。
在机体抵抗力不足或局部肠黏膜有损伤时，小滋养体可变为大滋养体(直径20～40?m)，能分泌溶组织酶破坏肠壁组织，侵入肠黏膜及黏膜下层，大量繁殖，形成局限性黏膜下脓肿，内容主要为坏死性物质，脓肿破裂，形成烧瓶样溃疡，溃疡与溃疡之间的黏膜基本正常，这一点与细菌性痢疾显然不同。
当机体抵抗力增强时，大滋养体可变为小滋养体，并可进一步变为包囊(直径10?m左右)，随粪便排出体外，在凉爽潮湿的环境中可生存2～4周，冰箱中可生活6～7周，但不耐热，50℃ 5min即死亡，只有4个核的成熟包囊，才有传染性，1～2个核的未成熟包囊无传染性，但在合适的外界环境中，可以发育成4个核的包囊，大小滋养体如排出体外，均很快死亡，如病程拖久，肠壁组织的破坏和结缔组织增生同时进行，可致肠壁肥厚，肠腔狭窄，偶可因结缔组织过度增生而形成“阿米巴瘤”。
