1.化脓性腮腺炎
根据临床表现及体征（腮腺局部红肿热痛，挤压腮腺时腮腺口有脓液流出，发病通常单侧，）。血常规白细胞总数增加，中性粒细胞比例明显上升，核左移，临床诊断不难。取腮腺导管流出的脓液进行细菌培养可以明确诊断。
2.流行性腮腺炎
根据流行情况及患者接触史，发热、以耳垂为中心的腮腺肿大，局部皮肤发热、紧张发亮但皮肤不红，通常可累及对侧腮腺，张口咀嚼及进食酸性饮食时疼痛加剧，可累及其他涎液腺、胰腺、睾丸或中枢神经系统等器官。查血常规白细胞数正常及减低（伴睾丸炎者白细胞计数可增高），血尿淀粉酶增高，可作出临床诊断。特异性腮腺炎病毒抗体IgM阳性（1个月内未注射疫苗），恢复期与急性期腮腺炎病毒抗体IgG≥4倍以上增高（含抗体阳转）可以确诊诊断。
需与其他自身免疫性腮腺炎、慢性非特异性腮腺炎、症状性腮腺炎、过敏性腮腺炎等相鉴别，一般伴有相应的临床表现，多为双侧，一般不伴急性感染症状，局部也无明显疼痛和压痛。
