免疫耐受主要存在于“大三阳”的慢性乙肝病毒携带期，免疫耐受性越强，病毒复制水平越高。即使血清病毒水平很高，免疫耐受性强也不会发病。然后随着年岁增长，免疫耐受性会逐渐衰落，免疫清除力会逐渐增强，使血清病毒水平逐渐降低。大约有25%“大三阳”慢性乙肝病毒携带者会发生慢性乙型肝炎，慢性肝炎发病了就说明免疫耐受性相对变弱了，但耐受性的强弱仍有很大差异：刚发病的“大三阳”慢性肝炎仍有相当的免疫耐受性，病毒水平较高而肝脏病变较轻；随着时间推移，耐受性逐渐削弱，病毒水平逐渐降低而病变却逐渐加重。
慢性乙型肝炎病人有治愈的可能吗
极大多数慢性乙型肝炎病人，如果不经过抗病毒治疗，可能病变会逐渐发展，最终约有40%加重为肝硬化；但也确有少数患者会自然好转。具体临床过程可以表现为三种情况。
第一种过程是炎症反复活动，但不用药物干预也可能出现减轻，表现为“好好坏坏”经过，这是非常多见的情况。多数是肝纤维化逐渐增多，病变进展；也有免疫逐渐增强的患者，最后能够自然恢复。
第二种过程是炎症急性加剧，由于某些原因，有些患者病情突然加重，血清转氨酶升高到正常值的10倍以上、甚至出现黄疸，极度疲乏、恶性呕吐。有人以为某些降酶药也能抗病毒，实际是大量复制病毒的肝细胞被破坏，病毒也被清除掉。等到炎症逐渐控制，血清转氨酶逐渐降低，此时多数人血清病毒还会逐渐增高。但也有少数人炎症活动后抗病毒免疫建立，而最终病情缓解。
