1、引起智齿冠周炎的主要原因有，咀嚼器官的退化，造成牙列与颅骨不协调萌出位置不正等主要原因。
2、下颌骨体部与下颌骨枝形成角度有差异、同样造成萌出困难。
3、下颌磨牙后区，咀嚼食物残渣滞留在冠周袋内、不易被清除，口腔自洁作用差，此处特别适宜细菌繁殖，再加上龈瓣被上牙咬伤同时机体抵抗力降低时而导致冠周炎。
4、智齿未全部萌生也是伴发智齿冠周炎直接原因。
主要由于下颌骨发育不良，第三磨牙萌出时缺少足够的位置，不能正常完全萌出，牙冠仅能部分萌出或牙冠位置偏斜，少数牙完全埋伏在骨内。临床上以垂直位软组织阻生的下颌第三磨牙冠周炎最多，究其原因是牙冠远中部分被龈组织覆盖，其间构成较深的盲袋，食物残渣进入盲袋后不易清洗排除。龈瓣盲袋中的温度与湿度利于细菌生长繁殖，当冠周软组织与龈瓣受到牙齿萌出时的压力，造成局部血运差，及咀嚼食物时遭到对侧牙的咬伤，细菌即可侵入。在机体抵抗力强时，局部症状不明显，但因工作疲劳、睡眠不足、月经期、分娩后或感冒等，全身抵抗力下降时，冠周炎可急性发作。
