对良性、非赘生性、囊肿的直径大小在5厘米以内，又无任何症状的卵巢囊肿，不必作特殊处理，大部分可被机体吸收，自然消失。如果囊肿的大小超过5厘米，定期观察时有发展趋势，或囊肿发展快、增大明显，则应入院手术治疗。手术为卵巢囊肿切除术，输卵管卵巢切除术，附件及全子宫切除。
卵巢囊肿的治疗方法
卵巢囊肿手术
良性卵巢囊肿的手术为卵巢囊肿切除术，输卵管卵巢切除术，附件及全子宫切除。多无月经障碍可行卵巢囊肿切除术，一侧卵巢囊肿发生于年龄较大(45岁以上)患者或是双侧卵巢囊肿多行一侧或双侧输卵管输卵巢切除术，患者周身情况不能胜任或炎症严重者常行全子宫切除术。恶性卵巢囊肿就诊时多已达晚期，多采取卷地毯式或包饺子式将子宫与肿瘤连同盆腹膜整块切除。
保守治疗
一般来说，如囊肿直径小于5厘米，又无证据提示肿瘤的话，可采取中医保守治疗;对于诊断出卵巢内有混合性包块的时候，其治疗女性卵巢囊肿的方法可以根据情况先进行保守治疗一到两个疗程，然后再复查B超，如果有缩小的话可以不手术，如果没有改变或者是甚至有长大，就必须进行手术了。
手术治疗
1..良性卵巢囊肿的手术治疗：
①卵巢囊肿切除术 此种患者多无月经障碍，甚至有合并妊娠者，有的一侧肿瘤较显着，则可行患侧输卵管卵巢切除术。
②输卵管卵巢切除术 一侧卵巢囊肿发生于年龄较大(45岁以上)患者，双侧卵巢囊肿多行一侧或双侧输卵巢切除术，患者周身情况不能胜任或炎症严重者常行全子宫切除术，值得注意的是关于较大卵巢囊肿的手术处理，应不计切口大小，以完整切除为宜，以免破患者脉搏内容物溢入腹腔或切口，术中要注意患者脉搏呼吸，血压的变动，必要时加速输液或输血，输氧，更要预防早期发现急性胃扩张，麻痹性肠梗阻以及由此而引起的水，电解质平衡失调与血液化学改变。
③附件及全子宫切除 发生于近绝经期或绝经期妇女的一侧或双侧卵巢囊肿，患者全身情况不能胜任，均以行双侧附件及全子宫切除为宜，但会严重影响内分泌失调。
2.恶性卵巢囊肿的手术治疗：
①多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆，腹腔转移灶。由于卵巢恶性囊肿常与子宫，附件粘连或浸润，浑然一体，且紧贴盆腹膜，故现多采取卷地毯式或包饺子式将子宫与肿瘤连同盆腹膜整块切除，又如大网膜切除，部分肠切除，部分膀胱，输尿管切除。
②对于合并腹水的卵巢恶性肿瘤，不论是否全部切除，均宜在腹腔内留置导管，以便术后腹腔内注射抗癌药剂或放射性胶体金或胶体磷。
