气功是否科学?这个问题大家很关心，但是很难回答。首先是什么叫气功现在还没有统一的认识。数学这门非常严格的科学还很难对什么叫数学下定义，气功更不用说了。有人把气功中一切不科学的东西都排除在外，那么剩下的当然都是科学的了。也有人把一切自称为气功的东西都包含在内，这样气功中不科学的东西就很多了。这里需要区别“某某学”和“某某学界”两个不同的概念。按常规的理解，某某学都是指某某学界中正确的部分，而不包含有意无意弄错的东西。对气功学和气功界也应该如此去理解。
有些气功师觉得自己教功。治病的效果都不错，怎么还不被承认为科学、甚至被指责为伪科学?另一方面有人认为在他们的文章和言论中不科学的话很多，怎么能自称科学?这里双方把事实和科学这两件事混淆了。科学与事实有紧密的联系，但又是不可混为一谈的两件事。
事实是指确实发生过的事。与事实对立的是神话、童话、臆想的故事，乃至种种虚假的报道。这种种虚假的事可总称为虚事。
事实是科学的基础，又是检验科学的唯一准则。从事实出发才可能获得科学的结论。如果从虚事出发，必然会得出错误甚至荒谬的结论。所以从事科学研究首先必须花大力气核实事实，分清事件的真假。
科学发展的历史表明，要从确凿的事实出发获得科学的结论决非轻而易举，一帆风顺。通常都是经过长期艰难曲折的探索，方达到现在公认的科学结论。例如太阳从东方升起和生物遗传现象，早已得到公认，但是对这些现象出现的原因，通过几百年乃至更长时间的争论才达到现在的认识。由此看来，在批判“伪科学”时须严格区分以下两种情况：
(1)在分清事实的虚实时，不要涉及该事件的学说。因为事件的虚实与人们对它作何解释(理解)无羌。
(2)同理，在批判“伪科学”时，不要连带否定已确定的事实。
以上两条在科技界早就是这么做的，现在对待新生的气功科学也应如此。
现在已有许多练动、教动效果和科学试验经过了核实，这是宝贵的事实，是发展气功科学的基础，又是检验气功科学的依据。但是现在对气功现象的本质和基本规律的研究还刚刚开始。理论大大落后于实践。不论对气功事实能否作出正确的解释，事实总归是事实，不应随便否定。实际上，气功现象极其复杂，要作出正确圆满的解释决非短期能完成的任务。当前出现一些不正确的解释是难免的。只要不是故意的弄虚作假，就不要指责为“伪科学”.更不要因此而连带否定己确认的事实。
真假是世界上一大类重要矛盾。但是真假不仅不是世界上唯一的矛盾，有时甚至不是主要矛盾。善恶、美丑是另外两大类矛盾，有时甚至是主要矛盾。所以人们常把真善美相提并论。真善美的对立面是假恶丑。
真的多数也是善的，假的多数是恶的丑的。但是也有不少例外。如果真即是善，真即是美，那么真善美就不用互相区别了、可相提并论了。真假、善恶、美丑三大类矛盾，有时重合，有时不重合。
科学处理的是真假问题。科学上的成就可用于为善，大多数也可用于为恶。在社会活动中，善恶矛盾总是主要矛盾，真假矛盾常放在第二位。邪恶的东西虽真也要反对，善的东西虽假也可在一定时期内有限制地保留，不可轻率地反对。科技工作者，由于习惯的影响，在参与社会问题的讨论时，容易不加思索地把真假放在善恶之前，这一点应引起警惕。
气功科学处理气功中的真假问题。气功科学是气功事业的一部分。现在气功已是一种群众性的社会活动，已是社会主义建设事业的一部分。所以气功的善恶问题同样应摆在真假问题之前。整顿气功首先应打击邪恶的。恶又假的东西要狠狠打击，恶而真的东西也应同样狠打。至于善而假的东西要谨慎处理，以免打假而引发邪气上升。
气功治病中的心理暗示，有些可能属于真而假的东西。现已公认，无论自练气功治病或接受外气治病，都有一定的心理作用。良性的心理作用对治病有利，应该尽量发挥它的作用。有人认为：装模作样地发放外气(其实没有发放外气)，仅凭心理暗示就能治好不少疑难疾病。
如果真有其事，它们就属于善而不真之事。有人在公开的报刊上声称发放外气全是假，心理暗示才是真。如果病人自以为接受外气而病愈，当他知道发放外气是假时，极易旧病复发，即使某人的病真由外气治愈，当社会上大量宣传外气是假时，他也可能由于心理暗示而使旧病复发。所以为了对群众负责、对社会负责，对待这类善而不真之事，在打假之前应该先安排好预防措施。
人们殷切地希望有关部门加强管理，扶正法邪两手都要硬，力求扶正而不益邪，法邪而不伤正。
