慢性肾功能衰竭的治疗方法包括内科疗法，透析疗法及肾移植术。透析疗法和肾移植术无疑是终末期肾衰患者最佳治疗选择，但由于这些疗法价格昂贵和供肾来源有限往往并不为大部分患者所接受。某些肾脏病患者在进展至终末期肾衰之前，通过合理的内科疗法，可延缓其病程进展的进度，少数尚能完全逆转，因此，应重视慢性肾功能衰竭的内科保守治疗。
1.原发病和诱因治疗
对于初次诊断的CRF患者，必须积极重视原发病的诊断，对慢性肾炎，狼疮性肾炎，紫癜性肾炎，IgA肾病，糖尿病肾病等，都需要保持长期治疗，同时，也应积极寻找CRF的各种诱发因素，合理纠正这些诱因有可能会使病变减轻或趋于稳定并较大程度的改善肾功能。
2.饮食疗法
慢性肾功能衰竭的饮食疗法历年来被认为是其基本的治疗措施，为各国学者所推崇，继往的饮食疗法一般仅限于应用低蛋白饮食，但长期低蛋白饮食会影响患者的营养状况，研究表明慢性肾功能衰竭营养不良发生率高达20%～50%，严重营养不良现认为是CRF独立的危险因素，直接同患病率与死亡率呈正相关，因此，目前的饮食疗法更倾向于给患者制定更合理的营养治疗方案。
3.替代疗法
包括血液透析，腹膜透析，肾移植，各有其优缺点，在临床应用上可互为补充。
（1）血液透析 应预先（血透前数周）做动-静脉内瘘（血管通路）；透析时间每周≥12小时，一般每周做3次，每次4～6小时；坚持充分合理的透析，可有效提高患者的生活质量，不少患者能存活20年以上。
（2）腹膜透析 持续性不卧床腹膜透析疗法（CAPD）对尿毒症的疗效与血液透析相同，CAPD尤适用于有心脑血管合并症患者，糖尿病患者，老年人，小儿患者或做动-静脉内瘘困难者，CAPD是持续地进行透析，尿毒症毒素持续地被清除，血流动力学变化小，保护残存肾功能优于血透，对存在心脑血管疾病的患者较血透安全，使用双联系统，腹膜炎等并发证的发病率已显著降低。
（3）肾移植 成功的肾移植能够恢复正常的肾功能（包括内分泌和代谢功能）。移植肾可由尸体或亲属供肾（由兄弟姐妹或父母供肾），要在ABO血型配型和HLA配型合适的基础上，选择供肾者，HLA配型佳者，移植肾的存活时间较长。
